开工在即,回顾过去的一年,百迈客医学团队服务广大科研工作者,可谓是丰收的一年。目前一共收录了24篇成功案例,包括转录组、全转录组、环状RNA、lncRNA、小RNA、外泌体、DNA甲基化、微生物多样性、全长转录组、微生物全长多样性等均有成果产出,其中有三篇影响因子高于10分的文章,分别发表于国际期刊Advancedscience(IF=15.84),JExtracellVesicles(IF=15),SciAdv(IF=13.),并且接近60%文章影响因子在3~5分范围内,可谓高质量产出。
合作项目主要涉及研究领域有癌症肿瘤、神经学科、生长发育、免疫反应、应激反应、微生物肠道菌群多样性等,为这些科研领域提供基础理论依据,同时为疾病治疗提供了方向。不同的研究方向都有哪些新进展?文章该如何求新立意呢?接下来让小编给各位娓娓道来,百迈客医学高分成功案例经验,供大家参考学习。
转录组学研究
成功案例1:多组学研究揭示转铁蛋白受体1调节棕色米色脂肪细胞的产热能力和细胞命运
英文标题:TransferrinReceptor1RegulatesThermogenicCapacityandCellFateinBrown/BeigeAdipocytes
期刊杂志:Advancedscience
影响因子:15.84
合作单位:浙江大学公共卫生医院广东省微生物研究所
文章概要
本文首先从3个组学(RNA-seq、Chip-seq、蛋白组)的数据着手,从不同层面找到变化较大的基因,找到关键的候选基因。再通过构建候选基因敲出小鼠模型,从表型、组织、mRNA、蛋白到机制,层层递进,逐步由浅到深解析。探究了Tfr1基因对棕色/米色脂肪组织产热能力和组织分化方面的功能,为肥胖与代谢疾病的治疗策略提供了新方向。这些发现表明Tfr1通过铁依赖和铁非依赖机制在产热脂肪细胞中发挥重要作用,对后续棕色和米色脂肪细胞的分化、调控糖脂代谢功能,以及肥胖与代谢疾病的提供了重要的依据。(文中RNA-seq由百迈客医学提供)
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成功案例2:鼻咽癌细胞的富含egfr的胞外囊泡通过PI3K/AKT通路抑制ROS加速肿瘤转移
英文标题:EGFR-richextracellularvesiclesderivedfromhighlymetastaticnasopharyngealcarcinomacellsacceleratetumourmetastasisthroughPI3K/AKTpathway-suppressedROS
期刊杂志:JExtracellVesicles
影响因子:15
合作单位:中山大学
文章概要
本研究中,作者证实了表皮生长因子受体(EGFR)在伴有远处转移的鼻咽癌患者的肿瘤组织中高表达,并与反应性氧自由基(ROS)的降低有关。实验还发现,细胞外囊泡(EVs)发生了从高转移到低转移鼻咽癌细胞之间的转移,介导细胞间的交流,并增强了低转移鼻咽癌细胞的转移潜能。进一步的实验表明,高转移性鼻咽癌细胞的EV诱导低转移性鼻咽癌细胞EGFR上调,ROS下调。机制上,富含EGFR的EVs介导的EGFR过表达通过PI3K/AKT通路下调细胞内ROS水平,从而促进转移能力较差的鼻咽癌细胞的转移潜能。值得注意的是,在异种移植小鼠中,高转移细胞分泌的EVs治疗与鼻咽癌样进展和缩短生存期显著相关。这些研究结果不仅加深了对EV介导的鼻咽癌转移机制的认识,而且对异常富EGFREV感染的鼻咽癌患者的检测和治疗也具有重要意义。(文中RNA-seq由百迈客医学提供)
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成功案例3:成纤维细胞生成自组织的感觉神经节类器官和视网膜神经节细胞
英文标题:Generationofself-organizedsensoryganglionorganoidsandretinalganglioncellsfromfibroblasts
期刊杂志:ScienceAdvances
影响因子:13.
合作单位:中山大学中山眼科中心眼科学国家重点实医院眼科中心
文章概要
本研究通过对多个SG和RGC转录因子TF的筛选,作者确定了三个TF组合ABI是重编程小鼠和人类成纤维细胞为自组织和网络化iSG类器官的最有效组合。通过免疫染色、qRT-PCR、全细胞膜片钳记录、钙成像以及混合bulk转录组和单细胞转录组scRNA-seq方法,能够证明iSG类器官具有分子和细胞特征、亚型多样性、电生理特性和周围神经支配能力和周围SG的特征模式。此外,使用免疫标记和scRNA-seq分析,鉴定出了真正的RGC特异性分子标记,以证明ABI组合具有从成纤维细胞诱导少量iRGC的额外能力。不同于内源性SG的ABI重编程的iSG类动物器官,iRGC保持类似于视网膜中内源性RGC的分散分布模式。(文中RNA-seq由百迈客医学提供)
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成功案例4:间充质干细胞和各种眼细胞之间通过线粒体的细胞间运输实现生物能crosstalk
英文标题:BioenergeticCrosstalkbetweenMesenchymalStemCellsandvariousOcularCellsthroughtheintercellulartraffickingofMitochondria
期刊杂志:Theranostics
影响因子:8.
合作单位:温州医院视网膜再生医疗研究组首都医科医院北京市眼科研究所
文章概要
这项研究中,作者利研究了线粒体从间充质干细胞转移到眼细胞的命运和相关特征。用免疫荧光、荧光激活细胞分选和共聚焦显微镜成像技术,研究细胞间线粒体转移的特征和转移线粒体的命运。测定受体细胞的耗氧速率,研究线粒体间转移的影响。通过转录组分析,研究具有捐赠线粒体的受体细胞中代谢基因的表达情况。本文首次确定线粒体通过f-actin隧道纳米管从间充质干细胞转移到各种眼细胞的特性和命运,有助于确定以间充质干细胞为基础的眼组织再生治疗。(文中RNA-seq由百迈客医学提供)
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成功案例5:慢性酒精摄入和HBV通过HBx-SWELL1-花生四烯酸信号传导诱导脂质代谢异常并激活HBV-Tg小鼠Treg细胞
英文标题:ChronicethanolconsumptionandHBVinduceabnormallipidmetabolismthroughHBx/SWELL1/arachidonicacidsignalingandactivateTregsinHBV-Tgmice
期刊杂志:Theranostics
影响因子:8.
合作单位:南开大学生命科学学院分子生物学研究所肿瘤研究室
文章概要
花生四烯酸代谢物前列腺素E2(PGE2)激活调节性T细胞(Tregs)功能,本文目的是研究慢性酒精摄入增加HBV诱导的异常脂质代谢和Treg的潜在机制。利用si-RNAs敲低HepG2、HepG2.2.15和K癌细胞株中SWELL1的表达,并对HepG2细胞进行RNA测序。采用ELISA法测定花生四烯酸代谢产物PGE2和LTD4的体内、体外含量。Westernblot和RT-qPCR检测临床HCC样本和细胞系中的HBx、SWELL1和转录因子Sp1。采用流式细胞术检测慢性乙醇摄入对HBV-Tg小鼠Tregs的影响,收集脾Treg并进行RNA测序分析,结果表明慢性乙醇摄入可通过HBx/SWELL1/花生四烯酸信号通路增强HBV-enhanced异常脂代谢,激活小鼠Tregs。(文中RNA-seq由百迈客医学提供)
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成功案例6:长期培养过程中维生素C通过抑制Notch3延缓牙周膜干细胞衰老
英文标题:VitaminCalleviatesthesenescenceofperiodontalligamentstemcellsthroughinhibitionofNotch3duringlong‐termculture
期刊杂志:JCellPhysiol
影响因子:5.
合作单位:电子科技大学医学院医院
文章概要
牙周膜干细胞(PDLSCs)作为牙周组织修复和再生的潜在“种子细胞”,需要在体外进行大规模扩增。长期培养过程中发生的PDLSC衰老可能会损害PDLSC的治疗效果。在长期培养过程中,经Vc处理的PDLSCs细胞保持细长的形态,较高的生长速率和迁移能力,干性和成骨分化能力。此外,低传代次数EPvs高传代次数LPvsLP+Vc处理转录组测序发现,Notch3在细胞衰老过程中显著上调,Vc处理通过抑制长期培养过程中的Notch3延缓了PDLSCs的衰老。总之,Vc处理通过减少Notch3的表达来抑制PDLSCs的衰老,这可能是一种在细胞长期培养过程中抑制细胞衰老的简单而有用的策略。(文中RNA-seq由百迈客医学提供)
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成功案例7:慢性皮质酮诱导的小鼠抑郁样行为伴随线粒体能量代谢破坏
英文标题:Depression-likebehaviorsareac